
No mundo interno do computador do Mainframe, um sprite de programa guardião e seus amigos defendem o sistema contra ameaças de vírus e do usuário..

Megabyte tenta chantagear Bob para estabilizar um rasgo em um portal para o supercomputador. Enquanto Bob foge com a ajuda de Dot, o usuário insere um jogo que estabiliza o rasgo. Bob e o resto dos sprites devem correr com Megabyte, que infectou o usuário, até o portal para ganhar o jogo e impedi-lo de obter acesso ao supercomputador.

Megabyte aproveita o novo serviço de entrega de Enzo para tentar entregar um comando de exclusão para Hexadecimal. Bob, sem saber, tenta entregar o pacote, apenas para ficar preso em um jogo de corrida onde o veículo do usuário se torna uma bomba-relógio.

Um acidente faz com que um ímã drene a energia de Dot e, de acordo com Phong, a única maneira de salvá-la é alimentá-la com comida lenta de Al's no nível 31. Enquanto em Al's, os sprites são pegos em um jogo de fantasia medieval onde Bob e o usuário estão tentando alcançar Dot, a donzela em perigo. Ou são?

Megabyte rouba o precioso Medusa Bug do Hexadecimal, mas descobre que é uma armadilha que transforma tudo no Mainframe em pedra.

Depois que Bob atrasa Dot para um compromisso, ela e Bob começam uma grande discussão. Parece que Dot de repente pensa que Bob é muito "aleatório" e Bob acha que Dot é muito direto. Enzo e os outros cidadãos do Mainframe tentam enganar os dois para que façam as pazes, mas nada parece funcionar. Quando Bob e Dot ficam presos em um cubo de jogo, isso será uma crise suficiente para fazê-los parar de brigar?

Frisket engole um comando não formatado que Megabyte acabara de descobrir. Querendo recuperá-lo, o vírus sequestrou Enzo, usando-o como isca para atrair o cachorro para o Silicon Tor.

O mainframe é atacado por covardes piratas de software, que rapidamente vasculham a cidade, levando tudo de valor incluindo Bob!

Depois que Bob o supera durante um jogo, Enzo decide ficar mais esperto rapidamente. A sala somente leitura no escritório principal é muito parecida com o trabalho do jovem sprite, então ele fica tentado a mexer no relógio do sistema. Só que em vez de se tornar duas vezes mais inteligente que todos os outros no Mainframe, ele acidentalmente torna todos os outros metade tão inteligentes! O que é pior, ele acaba preso em um cubo de jogo com um grupo de amigos idiotas. Enzo conseguirá derrotar o usuário sozinho e consertar essa bagunça?

Mike, a TV, está deixando todo mundo louco, mas quando um cubo de jogo cai e Mike se transforma em um guerreiro, eles vão precisar dele para ajudar a impedir o usuário.

Com a ajuda de Mouse, um mercenário contratado, Megabyte pretende enviar uma nave fortemente comprimida até a cabeça de Bob para assumir o controle de seu cérebro. Porém, as coisas não saem exatamente como planejado.

Dot está organizando uma comemoração para o primeiro aniversário de Enzo, e Bob precisa manter o jovem duende ocupado até que tudo esteja pronto.

Dot consegue convencer os binomes de um dos setores da Megabyte a confiar a ela seus PIDs, para que ela possa registrá-los na Diretoria. Mas primeiro ela precisa levá-los em segurança de volta ao Mainframe, o que se mostra mais difícil do que o previsto quando os vírus atacam o local de encontro. E se isso não bastasse, ela continua recebendo flashes misteriosos de uma realidade onde Megabyte assumiu o controle do sistema.

Com Dot presa em um jogo, fortemente deprimida e prestes a desistir, Phong decide tomar medidas drásticas, enviando-a para um futuro possível onde ela perdeu o jogo e fez com que ela e Bob fossem anulados.
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